El 21.Abr.2009 PROINVERSION convocó la concesión del Segundo Grupo de Aeropuertos de Provincia 06 aeropuertos), que incluye al aeropuerto de Arequipa.
El 15 de enero del 2011 se firmó el contrato de concesión con la empresa Aeropuertos Andinos del Perú, por 25 años, cofinanciada por el Estado. Para el aeropuerto de Arequipa se estima una inversión total de US$ 51.16 millones.
En el 2012 se dió incio a las obras de rápido impacto que comprende: obras menores en las vías de acceso, en la playa de estacionamiento, en el frontis y en las instalaciones del terminal; cuyo objetivo es mejorar las caracteristicas generales y aspectos arquitectónicos, así como la calidad del servicio a los usuarios.
Actualmente el Aeropuerto de Arequipa cuenta con mangas, dos salas diferenciadas de embarque y desembarque para vuelos nacionales e internacionales, una sala para revisión de equipaje y una modernizada zona de check in. También se cuenta con ascensores, escaleras eléctricas y un nuevo sistema de iluminación. La inversión total ejecutada a diciembre 2016 asciende a US$14.25 millones.
Para el año 2018 está programada iniciar la rehabilitación integral de la pista de aterrizaje y zona de estacionamiento de aeronaves.